Protein–RNA interactions for Protein: Q684R7

Frem1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem1Q684R7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Frem1Q684R7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms