Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms