Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms