Protein–RNA interactions for Protein: Q64302

Tm4sf1, Transmembrane 4 L6 family member 1, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf1Q64302 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tm4sf1Q64302 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tm4sf1Q64302 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tm4sf1Q64302 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tm4sf1Q64302 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tm4sf1Q64302 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tm4sf1Q64302 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tm4sf1Q64302 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tm4sf1Q64302 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tm4sf1Q64302 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tm4sf1Q64302 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tm4sf1Q64302 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tm4sf1Q64302 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tm4sf1Q64302 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tm4sf1Q64302 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tm4sf1Q64302 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tm4sf1Q64302 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tm4sf1Q64302 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tm4sf1Q64302 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tm4sf1Q64302 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tm4sf1Q64302 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tm4sf1Q64302 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tm4sf1Q64302 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tm4sf1Q64302 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tm4sf1Q64302 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tm4sf1Q64302 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tm4sf1Q64302 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tm4sf1Q64302 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tm4sf1Q64302 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tm4sf1Q64302 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tm4sf1Q64302 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tm4sf1Q64302 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tm4sf1Q64302 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms