Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zic2Q62520 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms