Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms