Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm20854Q62461 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm20854Q62461 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm20854Q62461 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm20854Q62461 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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Gm20854Q62461 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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Gm20854Q62461 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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Gm20854Q62461 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm20854Q62461 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm20854Q62461 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm20854Q62461 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm20854Q62461 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm20854Q62461 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm20854Q62461 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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Gm20854Q62461 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm20854Q62461 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm20854Q62461 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm20854Q62461 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm20854Q62461 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm20854Q62461 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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Gm20854Q62461 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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Gm20854Q62461 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm20854Q62461 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm20854Q62461 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm20854Q62461 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm20854Q62461 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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Gm20854Q62461 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm20854Q62461 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Gm20854Q62461 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Gm20854Q62461 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Gm20854Q62461 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Gm20854Q62461 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20854Q62461 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20854Q62461 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20854Q62461 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20854Q62461 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20854Q62461 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20854Q62461 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20854Q62461 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20854Q62461 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20854Q62461 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Gm20854Q62461 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
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