Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CcncQ62447 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CcncQ62447 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CcncQ62447 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CcncQ62447 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CcncQ62447 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CcncQ62447 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CcncQ62447 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CcncQ62447 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CcncQ62447 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CcncQ62447 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CcncQ62447 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms