Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TrhQ62361 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TrhQ62361 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TrhQ62361 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TrhQ62361 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TrhQ62361 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TrhQ62361 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms