Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Kdm5dQ62240 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Kdm5dQ62240 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Kdm5dQ62240 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Kdm5dQ62240 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Kdm5dQ62240 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Kdm5dQ62240 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Kdm5dQ62240 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Kdm5dQ62240 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Kdm5dQ62240 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Kdm5dQ62240 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Kdm5dQ62240 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Kdm5dQ62240 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Kdm5dQ62240 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Kdm5dQ62240 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Kdm5dQ62240 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Kdm5dQ62240 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Kdm5dQ62240 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Kdm5dQ62240 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Kdm5dQ62240 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Kdm5dQ62240 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Kdm5dQ62240 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Kdm5dQ62240 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Kdm5dQ62240 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Kdm5dQ62240 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Kdm5dQ62240 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Kdm5dQ62240 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Kdm5dQ62240 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Kdm5dQ62240 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Kdm5dQ62240 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Kdm5dQ62240 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Kdm5dQ62240 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Kdm5dQ62240 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Kdm5dQ62240 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Kdm5dQ62240 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Kdm5dQ62240 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Kdm5dQ62240 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Kdm5dQ62240 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Kdm5dQ62240 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Kdm5dQ62240 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Kdm5dQ62240 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Kdm5dQ62240 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Kdm5dQ62240 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Kdm5dQ62240 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Kdm5dQ62240 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Kdm5dQ62240 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Kdm5dQ62240 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Kdm5dQ62240 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Kdm5dQ62240 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Kdm5dQ62240 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Kdm5dQ62240 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Kdm5dQ62240 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Kdm5dQ62240 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Kdm5dQ62240 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Kdm5dQ62240 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Kdm5dQ62240 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Kdm5dQ62240 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Kdm5dQ62240 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Kdm5dQ62240 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Kdm5dQ62240 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Kdm5dQ62240 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Kdm5dQ62240 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Kdm5dQ62240 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Kdm5dQ62240 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Kdm5dQ62240 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Kdm5dQ62240 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Kdm5dQ62240 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Kdm5dQ62240 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Kdm5dQ62240 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Kdm5dQ62240 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Kdm5dQ62240 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Kdm5dQ62240 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Kdm5dQ62240 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Kdm5dQ62240 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Kdm5dQ62240 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Kdm5dQ62240 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Kdm5dQ62240 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Kdm5dQ62240 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Kdm5dQ62240 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Kdm5dQ62240 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Kdm5dQ62240 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Kdm5dQ62240 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Kdm5dQ62240 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Kdm5dQ62240 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Kdm5dQ62240 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Kdm5dQ62240 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Kdm5dQ62240 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Kdm5dQ62240 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Kdm5dQ62240 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Kdm5dQ62240 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Kdm5dQ62240 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Kdm5dQ62240 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Kdm5dQ62240 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Kdm5dQ62240 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Kdm5dQ62240 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Kdm5dQ62240 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Kdm5dQ62240 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Kdm5dQ62240 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Kdm5dQ62240 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Kdm5dQ62240 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms