Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms