Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sema3cQ62181 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sema3cQ62181 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sema3cQ62181 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sema3cQ62181 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sema3cQ62181 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sema3cQ62181 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Sema3cQ62181 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sema3cQ62181 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sema3cQ62181 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sema3cQ62181 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Sema3cQ62181 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sema3cQ62181 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sema3cQ62181 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sema3cQ62181 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sema3cQ62181 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sema3cQ62181 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sema3cQ62181 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sema3cQ62181 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sema3cQ62181 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sema3cQ62181 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sema3cQ62181 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sema3cQ62181 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sema3cQ62181 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sema3cQ62181 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sema3cQ62181 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sema3cQ62181 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sema3cQ62181 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Sema3cQ62181 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Sema3cQ62181 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Sema3cQ62181 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sema3cQ62181 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms