Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SspnQ62147 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SspnQ62147 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SspnQ62147 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SspnQ62147 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SspnQ62147 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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