Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms