Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms