Protein–RNA interactions for Protein: Q61897

Krt33b, Keratin, type I cuticular Ha3-II, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33bQ61897 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms