Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms