Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms