Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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PcolceQ61398 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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PcolceQ61398 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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PcolceQ61398 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PcolceQ61398 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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PcolceQ61398 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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PcolceQ61398 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms