Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms