Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Irf9Q61179 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms