Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lamb3Q61087 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lamb3Q61087 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lamb3Q61087 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Lamb3Q61087 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lamb3Q61087 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lamb3Q61087 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Lamb3Q61087 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lamb3Q61087 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lamb3Q61087 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lamb3Q61087 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lamb3Q61087 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lamb3Q61087 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lamb3Q61087 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lamb3Q61087 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lamb3Q61087 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lamb3Q61087 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lamb3Q61087 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms