Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd3Q61060 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Foxd3Q61060 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Foxd3Q61060 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd3Q61060 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd3Q61060 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd3Q61060 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd3Q61060 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd3Q61060 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd3Q61060 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd3Q61060 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd3Q61060 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd3Q61060 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd3Q61060 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd3Q61060 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd3Q61060 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd3Q61060 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd3Q61060 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd3Q61060 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd3Q61060 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd3Q61060 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd3Q61060 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd3Q61060 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd3Q61060 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd3Q61060 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd3Q61060 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd3Q61060 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd3Q61060 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd3Q61060 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd3Q61060 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd3Q61060 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd3Q61060 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd3Q61060 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd3Q61060 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd3Q61060 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd3Q61060 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd3Q61060 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd3Q61060 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd3Q61060 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd3Q61060 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd3Q61060 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd3Q61060 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms