Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms