Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
JrkQ60976 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
JrkQ60976 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
JrkQ60976 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
JrkQ60976 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
JrkQ60976 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
JrkQ60976 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
JrkQ60976 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
JrkQ60976 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
JrkQ60976 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
JrkQ60976 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
JrkQ60976 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
JrkQ60976 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms