Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms