Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms