Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DbpQ60925 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DbpQ60925 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DbpQ60925 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DbpQ60925 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DbpQ60925 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DbpQ60925 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DbpQ60925 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms