Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Neurod1Q60867 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms