Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf8Q60846 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf8Q60846 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf8Q60846 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf8Q60846 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf8Q60846 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf8Q60846 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf8Q60846 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf8Q60846 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf8Q60846 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf8Q60846 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfrsf8Q60846 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfrsf8Q60846 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfrsf8Q60846 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfrsf8Q60846 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfrsf8Q60846 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfrsf8Q60846 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfrsf8Q60846 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfrsf8Q60846 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms