Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms