Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms