Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms