Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CttnQ60598 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CttnQ60598 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CttnQ60598 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CttnQ60598 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CttnQ60598 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CttnQ60598 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CttnQ60598 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms