Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms