Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms