Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms