Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWP3

Nacad, NAC-alpha domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NacadQ5SWP3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NacadQ5SWP3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NacadQ5SWP3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NacadQ5SWP3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NacadQ5SWP3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NacadQ5SWP3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NacadQ5SWP3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NacadQ5SWP3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NacadQ5SWP3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
NacadQ5SWP3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NacadQ5SWP3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NacadQ5SWP3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NacadQ5SWP3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NacadQ5SWP3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NacadQ5SWP3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NacadQ5SWP3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NacadQ5SWP3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NacadQ5SWP3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NacadQ5SWP3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NacadQ5SWP3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NacadQ5SWP3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NacadQ5SWP3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NacadQ5SWP3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NacadQ5SWP3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NacadQ5SWP3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NacadQ5SWP3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NacadQ5SWP3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
NacadQ5SWP3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NacadQ5SWP3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NacadQ5SWP3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NacadQ5SWP3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NacadQ5SWP3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NacadQ5SWP3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NacadQ5SWP3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NacadQ5SWP3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NacadQ5SWP3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NacadQ5SWP3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NacadQ5SWP3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
NacadQ5SWP3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NacadQ5SWP3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NacadQ5SWP3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NacadQ5SWP3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NacadQ5SWP3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NacadQ5SWP3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NacadQ5SWP3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NacadQ5SWP3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
NacadQ5SWP3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NacadQ5SWP3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NacadQ5SWP3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NacadQ5SWP3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NacadQ5SWP3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NacadQ5SWP3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NacadQ5SWP3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
NacadQ5SWP3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NacadQ5SWP3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NacadQ5SWP3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NacadQ5SWP3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NacadQ5SWP3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NacadQ5SWP3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NacadQ5SWP3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NacadQ5SWP3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NacadQ5SWP3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NacadQ5SWP3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NacadQ5SWP3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NacadQ5SWP3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NacadQ5SWP3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NacadQ5SWP3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NacadQ5SWP3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NacadQ5SWP3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
NacadQ5SWP3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NacadQ5SWP3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
NacadQ5SWP3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NacadQ5SWP3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NacadQ5SWP3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NacadQ5SWP3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NacadQ5SWP3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NacadQ5SWP3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NacadQ5SWP3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NacadQ5SWP3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NacadQ5SWP3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NacadQ5SWP3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NacadQ5SWP3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NacadQ5SWP3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NacadQ5SWP3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NacadQ5SWP3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NacadQ5SWP3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
NacadQ5SWP3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
NacadQ5SWP3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
NacadQ5SWP3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
NacadQ5SWP3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
NacadQ5SWP3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
NacadQ5SWP3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
NacadQ5SWP3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
NacadQ5SWP3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NacadQ5SWP3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NacadQ5SWP3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NacadQ5SWP3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NacadQ5SWP3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NacadQ5SWP3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NacadQ5SWP3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.8 ms