Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms