Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms