Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms