Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms