Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc88aQ5SNZ0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc88aQ5SNZ0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc88aQ5SNZ0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc88aQ5SNZ0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc88aQ5SNZ0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc88aQ5SNZ0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc88aQ5SNZ0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc88aQ5SNZ0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc88aQ5SNZ0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc88aQ5SNZ0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc88aQ5SNZ0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc88aQ5SNZ0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc88aQ5SNZ0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc88aQ5SNZ0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc88aQ5SNZ0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc88aQ5SNZ0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc88aQ5SNZ0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc88aQ5SNZ0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc88aQ5SNZ0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc88aQ5SNZ0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc88aQ5SNZ0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc88aQ5SNZ0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc88aQ5SNZ0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc88aQ5SNZ0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc88aQ5SNZ0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms