Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trdv4Q5R1A3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trdv4Q5R1A3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trdv4Q5R1A3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trdv4Q5R1A3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trdv4Q5R1A3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trdv4Q5R1A3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trdv4Q5R1A3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trdv4Q5R1A3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trdv4Q5R1A3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trdv4Q5R1A3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trdv4Q5R1A3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trdv4Q5R1A3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trdv4Q5R1A3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trdv4Q5R1A3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trdv4Q5R1A3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trdv4Q5R1A3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trdv4Q5R1A3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Trdv4Q5R1A3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trdv4Q5R1A3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trdv4Q5R1A3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trdv4Q5R1A3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trdv4Q5R1A3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Trdv4Q5R1A3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trdv4Q5R1A3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trdv4Q5R1A3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trdv4Q5R1A3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trdv4Q5R1A3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trdv4Q5R1A3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trdv4Q5R1A3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trdv4Q5R1A3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Trdv4Q5R1A3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trdv4Q5R1A3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trdv4Q5R1A3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trdv4Q5R1A3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trdv4Q5R1A3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trdv4Q5R1A3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trdv4Q5R1A3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trdv4Q5R1A3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trdv4Q5R1A3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trdv4Q5R1A3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trdv4Q5R1A3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trdv4Q5R1A3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trdv4Q5R1A3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms