Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms