Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCY0

Kdm6b, Lysine-specific demethylase 6B, mousemouse

Predictions only

Length 1,641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6bQ5NCY0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm6bQ5NCY0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm6bQ5NCY0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm6bQ5NCY0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm6bQ5NCY0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm6bQ5NCY0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm6bQ5NCY0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm6bQ5NCY0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm6bQ5NCY0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm6bQ5NCY0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm6bQ5NCY0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm6bQ5NCY0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm6bQ5NCY0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm6bQ5NCY0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm6bQ5NCY0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm6bQ5NCY0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm6bQ5NCY0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm6bQ5NCY0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm6bQ5NCY0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm6bQ5NCY0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm6bQ5NCY0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm6bQ5NCY0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm6bQ5NCY0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm6bQ5NCY0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm6bQ5NCY0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm6bQ5NCY0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm6bQ5NCY0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm6bQ5NCY0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm6bQ5NCY0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm6bQ5NCY0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm6bQ5NCY0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm6bQ5NCY0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Kdm6bQ5NCY0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Kdm6bQ5NCY0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Kdm6bQ5NCY0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Kdm6bQ5NCY0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Kdm6bQ5NCY0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Kdm6bQ5NCY0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Kdm6bQ5NCY0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Kdm6bQ5NCY0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms