Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms