Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWH3

Grhl3, Grainyhead-like protein 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grhl3Q5FWH3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grhl3Q5FWH3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms