Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpm3Q5F4S9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms