Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc8bQ5DU41 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms